Pri práci a starostlivosti o disk je potrebné dodržiavať niekoľko zásadných pravidiel, aby disk ostal nepoškodený a mohol spoľahlivo slúžiť čo najdlhšiu dobu.

• Disk je nutné chrániť pred otrasmi. Hlavy sa totiž pohybujú tesne nad platňami a mohlo by dojsť k poškodeniu ako leštenej magnetickej vrstvy tak aj hláv. V dnešnej dobe majú disky dosť vysokú odolnosť voči otrasom - v činnosti 30-65 G/2 ms, v pokoji 250-350 G, ale i tak treba byť opatrný.
• Nie je vhodné často zapínať a vypínať počítač, pretože v okamihu zapnutia a vypnutia sa hlavy ešte dotýkajú parkovacieho miesta disku. Čím častejší je takýto dotyk, tým skôr sa môže disk opotrebovať. Nedoporučuje sa preto vypínať počítač na krátku dobu.
• Disk treba chrániť aj pred prudkými zmenami teploty a vždy po prudkom prechode medzi veľkým teplotným rozdielom je nutné nechať počítač na chvíľu aklimatizovať na novú teplotu pred jeho zapnutím (zabráni sa napríklad kondenzácii vody pri prechode z chladnejsieho do teplejšieho prostredia). Takisto treba dávať pozor, aby disk nepracoval v príliš horúcich podmienkach, a aby mal dostačujúce vlastné chladenie. Teplota by nemala prekročiť 40°C (niektorí výrobcovia udávajú 60°C). Teplotu disku možno monitorovať napríklad aj Motherboard monitorom, niektoré disky si samé kontrolujú svoju teplotu a informujú o nej.
• Rozhodne sa odporúča dáta na disku pravidelne zálohovať, aby sa zabránilo ich strate poškodením disku alebo napadnutím vírusom.
• Pravidelne by sa mala vykonávať defragmentácia disku, čím sa fragmentované bloky na disku spoja a vytvorí sa tak celistvé voľné miesto. Toto výrazne urýchli prácu disku.
• Aj napriek správnej údržbe sa môžu na disku vyskynúť rôzne chyby (napríklad chybné sektory, neplatné adresáre alebo prekrížené súbory). Vačšinu z nich dokáže lokalizovať aj opraviť program na údržbu disku.